Perturbations

Tout déséquilibre, également appelé dysbiose, dans le microbiome est associé à l’apparition et à la progression d’une série de maladies chroniques telles que le syndrome du côlon irritable, les maladies inflammatoires de l’intestin, l’obésité, les maladies à médiation immunitaire, les troubles métaboliques, le cancer, les infections et même les troubles psychologiques. Ainsi, ces dernières années, l’intérêt pour le rôle du microbiote intestinal dans la santé et la maladie a connu une forte progression.

La dysbiose peut survenir en raison de l’environnement, de l’alimentation, de la maladie et de certains médicaments.

La recherche fait progresser notre compréhension de l’environnement en tant que moteur majeur de la variabilité du microbiome. Le tractus orodigestif et le système respiratoire sont des voies d’entrée majeures permettant à l’environnement externe d’impacter le microbiome humain. Les facteurs macro-environnementaux tels que les toxines et les produits chimiques, le changement climatique et la chaleur extrême peuvent entraîner des changements physiologiques susceptibles de favoriser certains microbiotes environnementaux. Les communautés bactériennes et fongiques de l’environnement du bâtiment où nous habitons peuvent également être impliquées dans les modifications du microbiote. On considère que les facteurs socio-économiques ont un impact sur le microbiome en raison de l’accès limité aux soins médicaux et dentaires et de la diminution des pratiques d’alimentation saine et d’exercice. De plus, nos contributions à notre microenvironnement, telles que le tabagisme, l’alcool, l’alimentation et l’hygiène personnelle, peuvent pousser l’équilibre du microbiome vers un état plus ou moins sain.

Les « bactéries saines » telles que les bifidobactéries et les lactobacilles sont souvent moins abondantes chez les personnes de plus de 60 ans et celles souffrant de maladies chroniques telles que le diabète, l’obésité et les maladies cardiaques. Une telle dysbiose peut rendre l’intestin plus sensible aux infections, à l’inflammation et aux maladies auto-immunes telles que la maladie de Crohn et la colite ulcéreuse.

Le microbiome intestinal est fortement influencé par la fragilité des personnes âgées, la réduction de l’exercice, les maladies chroniques et les médicaments sur ordonnance, en particulier les médicaments psychoactifs et antihypertenseurs. Toute dysbiose peut avoir un impact sur l’axe intestin-cerveau, qui est une voie de signalisation biochimique bidirectionnelle entre le tractus intestinal et le système nerveux central. Sans surprise, il existe souvent un état de dysbiose dans les intestins des patients atteints de la maladie d’Alzheimer.

L’effet du microbiote sur l’axe intestin-cerveau est également connu pour influencer les troubles de l’humeur. Il a été observé que les personnes souffrant de troubles intestinaux ont une comorbidité élevée de dépression et d’anxiété.
Le stress est souvent suivi de dépression et d’anxiété. Cependant, toutes les personnes qui ont été victimes de stress n’ont pas de conséquences émotionnelles négatives ultérieures et ne sont pas considérées comme résistantes au stress. Il est de plus en plus évident que cette résilience au stress est liée à un équilibre favorable du microbiote intestinal.

Les antibiotiques à large spectre réduisent la diversité du microbiote intestinal, détruisant le pathogène préoccupant mais aussi les micro-organismes commensaux. Ce remodelage du microbiote dans l’intestin affecte la régulation immunitaire et les activités métaboliques, entraînant une sensibilité accrue aux infections par des agents pathogènes tels que C. difficile. De plus, la surutilisation des antibiotiques a conduit à une crise mondiale de la résistance aux antibiotiques.

Certains médicaments affectent le microbiote intestinal, qui peut métaboliser les médicaments en les transformant en divers métabolites. Cette relation bidirectionnelle peut contribuer à expliquer les différences dans les réponses au même médicament observées entre différents individus. Cette interaction entre les microbes intestinaux et les médicaments non antibiotiques couramment utilisés a également suscité un vif intérêt. Les médicaments tels que les anti-inflammatoires non stéroïdiens, les statines, les antipsychotiques et les analgésiques peuvent tous altérer le microbiome intestinal. On pense que jusqu’à 25 % de tous les médicaments non antibiotiques inhibent la croissance d’au moins une bactérie.
Certains médicaments pour le traitement du diabète de type II, tels que la metformine, montrent une efficacité accrue lorsqu’ils sont administrés par voie orale mais pas lorsqu’ils sont administrés par voie intraveineuse, laissant supposer un rôle thérapeutique essentiel du tractus gastro-intestinal. Les effets secondaires de nombreux médicaments comprennent des symptômes gastro-intestinaux. À ce titre, de nombreux essais cliniques sont en cours pour étudier le rôle des médicaments dans la régulation du microbiome intestinal et l’amélioration de l’efficacité des médicaments et des produits biologiques.

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